Начиная с даты своего основания в 1939 году, институт «Кавжелдорпроект» постоянно наращивал объемы выполняемых работ и расширял сферы своей деятельности. Коллектив института прошел путь от выполнения небольших проектных работ для восстановления и ремонта объектов железнодорожного транспорта до проектирования объектов федерального значения. В 2006 году в рамках структурной реформы ОАО «РЖД» институт «Кавжелдорпроект» вошел в состав АО «Росжелдорпроект», став ведущим филиалом по проектированию железнодорожной инфраструктуры на Юге России.
Институт выполнил масштабные проекты строительства: комплексная реконструкция железнодорожных подходов к портам Азово-Черноморского бассейна с обходом Краснодарского железнодорожного узла, строительство новой железнодорожной линии Журавка-Миллерово в обход Украины, строительство инфраструктуры для обслуживания пассажиров на станциях Кутейниково и Гудермес, капитальный ремонт железнодорожной инфраструктуры Абхазской железной дороги, техническое перевооружение инфраструктурных объектов железной дороги в Чеченской Республике, строительство объектов железнодорожной инфраструктуры при подготовке к Олимпиаде в Сочи 2014 года и другие.